Seperti kebanyakan sekolah Australia, The Scots College menggunakan sistem rumah. Scots mempunyai 13 rumah pelajar, 5 daripadanya adalah asrama. Setiap tahun rumah-rumah tersebut mengambil bahagian dalam banyak pertandingan akademik dan sukan, yang tersebar sepanjang tahun sekolah, dan diberikan mata mengikut penempatan mereka. Sistem mata ini menentukan pemenang House Championship setiap tahun (diumumkan pada perhimpunan terakhir). Setiap hari kanak-kanak lelaki mengandungi antara 90 dan 95 pelajar, sementara rumah tumpangan mempunyai antara 50 dan 65.

Lima [[asrama] sekolah itu bernama Macintyre, Kirkland, Aspinall, Fairfax dan Royle. Sebagai tambahan kepada rumah tumpangan, sekolah ini mempunyai rumah anak lelaki selama lapan hari: James Bee, Fraser, Anderson, Macky, Bruce, Armstrong, Gilchrist, dan Brandt.